אביו: ר' יהודה (בעל "יד יהודה").
אמו: דונה.
אשתו: רחל.
בניו: ר' יהושע חיים יהודה, ר' נסים אברהם (בעל "מעשה אברהם") ושמואל.
סבא: ר' יוסף (מצד אביו), ר' ברזילי יעבץ בעל "לשון לימודים" (מצד אמו).
מתלמידיו: ר' משה אלגראנאטי, ר' רפאל מרדכי יהושע שאול (בעל "דובר מישרים").
נולד בשנת ה'תקט"ו בעיר איזמיר (טורקיה).
בילדותו למד עם אביו אך בט"ז טבת ה'תקכ"א התייתם מאביו.
יומם ולילה שקד על לימוד התורה, ניכר בכישרונותיו ובמידותיו הנעלות והחל לכהן כדיין.
נשא לאשה את בתו של ר' חיים שוחמי.
הוציא לאור את כתבי היד של אביו ומונה לרב העיר איזמיר. רבים הגיעו להאזין לדרשותיו, בנועם דבריו היה מוכיח את הזולת והשכין שלום בין איש לרעהו. נודע בחכמתו ובקיאותו בתורה ור' חיים פלאג'י (בעל "מועד לכל חי") כינה אותו "המלאך רפאל מלך ישראל".
בשנת ה'תקנ"ה אמו נפטרה.
בכ"ג סיון ה'תקס"ח זוגתו נפטרה.
במשך שנים סבל ייסורים ובליל שבת שנת ה'תקפ"ו הפסיק לדבר עד שביום שלישי לפנות ערב השיב את נשמתו ליוצרה.
מספריו: