אביו: ר' נפתלי הירש.
אמו: הרבנית רבקה.
אשתו: מרת הנלי.
בנו: ר' יעקב.
אחיו: ר' חיים.
סבא: ר' משה אפרים זלמן שור (מצד אביו), ר' ישראל (מצד אמו).

צאצא לר' יוסף בכור מבעלי התוספות.
כיהן כרב בשברשין ובהורודנא.
נשא לאישה את בתו של ר' שאול וואהל [קצנלבוגן] ולאחר פטירתו החל לכהן כרב בבריסק.
לאחר פטירת אביו בשנת ה'שמ"ז מונה לרב הקהילה בלובלין.
בשנת ה'שצ"ג חלה ובעצת הרופאים יצא למקום מרגוע מחוץ לעיר, זמן קצר לאחר מכן חלה ר' יצחק אייזיק ונפטר אולם לא הודיעו לר' אפרים על מנת לא לצערו ובכל פעם ששאל לשלומו התחמקו מלהשיב. טרם פטירתו בשנת ה'שצ"ד הגיעו ראשי קהילת זלקובה לבקרו ולשאלתו אם ר' יצחק אייזיק חי השיבו בחיוב, אולם ר' אפרים טען כי ר' יצחק אייזיק עומד לפניו ומבקש שאקבר בסמוך אליו, לאחר שהשיב את נשמתו ליוצרה אנשי החברה קדישא לא מצאו מקום פנוי בסמוך לקברו של ר' יצחק אייזיק אולם כאשר החלו לחפור ראו כי המקום מתרחב.
מספריו:
• תבואת שור (ק)